Все дело в том, что древо цвело и давало плоды, а после выстрела и гибели на древе полудемона Яши, оно перестало плодоносить. Посему я считаю, что Кагомэ пролила кровь, об этом также говорит эпизод, когда она подошла к этому дереву спустя много лет и прикоснулась пальцем к отверстию в стволе. Она почувствовала боль и увидела, что из пальца пошла кровь. Значит все сходится. Я думаю Яша хотел заполучить ее душу, но не всю, а только темный из ее осколков. Но девушка его пригвоздила на многие годы к дереву. Она разбила собранный им камень темных душ на многие осколки, тем самым освободила зло. Поэтому своим выстрелом она выпустила зло